上海理工大学张永庆教授介绍，总部经济聚集区分零售业为主的萌芽阶段，中心商业与商务办公平衡的成长阶段和以商务办公为主的成熟阶段。有些城市和地区忽视自身的发展阶段及特点，盲目追求高端商务，大搞总部地产，势必造成资源浪费，耽误发展适应当地经济模式的时机。

不少地区在引进总部资源方面予以非常优惠的政策，如对入驻企业总部予以税收减免、财政奖励等。专家认为，长期看，这无助于提高总部归属感。建设总部聚集区，要选择本地产业基础较好的企业总部为重点，发展相关配套服务。

“我在南京，几个主城区都要我谈总部经济，各个区都在谈总部。我不反对多发展总部经济，但是我认为总部经济要分层次，要强调它的集群、不同区域应该有一个鲜明的特色。”洪银兴提醒政府对南京各个区域总部的布局进行分类指导，按照集群的思想，同类产业的总部在某一个区相对集中，不要在城市内部构成竞争。